Für eine zielgenaue und effektive Bearbeitung ausgewählter Bereiche der maritimen Technik hat die GMT folgende Arbeitsgruppen eingerichtet, die jeweils unter der Leitung eines von der GMT berufenen Branchenexperten sowie GMT-Vorstandsmitgliedern stehen:
 
Arbeitsgruppe Fachgruppenleiter /
Ansprechpartner im GMT-Vorstand
• Aquakultur Prof. Volker Hilge
Dr. Joachim Schwarz
• Erneuerbare Energien Jörgen Thiele
Dr. Joachim Schwarz
• Gashydrate / Meeresbergbau Johannes Post
Michael Jarowinsky
• Küstenzonenmanagement / Wasserbau Kai Ahrendt
Dr. Walter Kühnlein
• Meeresforschungstechnik Torsten Turla
Petra Mahnke
• Messtechnik Heinz Schelwat
Johannes Post
• Offshore- und Unterwassertechnik Dieter Koenig
N.N.
• Polartechnik Dr. Walter Kühnlein
Dr. Joachim Schwarz
• Regenerative Meeresenergien Jürgen Spahr
Torsten Turla